Главная
страница 1страница 2страница 3

Второй этап работы начинается с проведения сравнительная геномная гибридизация (CGH) образцов с предраковыми заболеваниями желудка, ранними стадиями малигнизации эпителия желудка. Далее планируется провести анализ полученных профилей с целью получения полногеномных данных о цитогенетических нарушениях в тканях предраковых заболеваний желудка и ранних стадий данной неоплазии. Получение информации о цитогенетических нарушениях в тканях с предраковыми заболеваниями и ранними стадиями рака желудка. Кроме того, данные об уровне и спектре хромосомных аномалий в тканях с предраковыми заболеваниями и ранними стадиями рака желудка являются значимыми при построении генетического портрета предраковых состояний эпителия желудка. Далее планируется подготовка статьи к публикации в журнале, рекомендованном ВАК со ссылкой на проведение НИР в рамках реализации ФЦП. Конечным этапом проведения исследования является резюмирование результатов, полученных в течение всего периода исследования, в виде итогового научно-технического отчета, а также подготовка отчетной документации.


4. РЕЗУЛЬТАТЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ

И ТЕОРИТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

В ходе проделанной работы за 2009 год был проведен аналитический обзор литературы по вопросу хромосомных нарушений в тканях предраковых заболеваний желудка и опухолевых тканей данного органа. Также были исследованы вопросы эпидемиологии, патоморфологии и клинических-морфологических характеристик рака желудка. На базе клинического отдела НИИ онкологии СО РАМН был собран биопсийный и операционный материал ранних раков и предраковых заболеваний желудка. На базе данного материала были сформированы две выборки: 34 образца опухолевых тканей и 69 образцов тканей предраковых заболеваний эпителия желудка. В ходе проделанной работы за 2009 год методом фенольной экстракции было выделено 65 образцов ДНК из опухолевых тканей и тканей предраковых заболеваний желудка, определена концентрация ДНК во всех 65 образцах. За период выполнения первого этапа работы составлена база данных пациентов с гистологически подтвержденным диагнозом заболевания для 103 человек. Подготовлена отчетная документация за первый этап выполнения научно-исследовательской работы.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Предраковые заболевания желудка являются первой начальной стадией развития опухолевого процесса. Получение общей картины нарушений хромосомного материала в клетках данных патологических состояний с диспластическими изменениями в ходе реализации данного научно-исследовательского проекта будет способствовать накоплению новых знаний о канцерогенных процессах на ранних стадиях развития неоплазии желудка до клинических проявлений опухоли. Кроме того, сравнение уровня и спектра хромосомных аберраций в клетках предраковых заболеваний желудка и зрелых опухолей, возможно, откроет механизмы клонального отбора диспластических клеток с определенным генетическим портретом, обеспечивающим быстрый рост и развитие опухоли, что определит выбор необходимой предопухолевой терапии для своевременного воздействия на морфологически измененные ткани эпителия желудка. Поиск возможных генетических маркеров для ранней диагностики заболевания и применение их в диагностике, позволит выявлять трансформацию клеток на ранних этапах и предотвращать развитие болезни.

На данном этапе работы основными результатами являются аналитический обзор научно-практической литературы и баз данных по исследуемому вопросу, создание банка тканей в количестве 103 образцов, биопсийного и операционного материала предраковых заболеваний эпителия желудка, создание банка ДНК, в количестве 65 образцов, выделенной с помощью метода фенольной экстракции и определение концентрации с помощью прибора Nanodrop1000, а также создание базы данных по всем образцам биопсийного и операционного материала с известным гистологическим диагнозом. Полученные результаты на данном этапе выполнения работы являются основной базой для выполнения всей планируемой работы. Структурирование полученных данных по количеству образцов тканей, ДНК, гистологический диагноз, создание баз данных, позволят оптимизировать дальнейшие исследования и получить верифицированные данные о хромосомных нарушениях в тканях с предраковой патологией эпителия желудка.

Решение вопросов хромосомных нарушений в тканях желудка на ранних стадиях трансформации является актуальным направлением исследований в области изучения цитогенетики как злокачественных новообразований в целом, так и рака желудка в частности.


СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

  1. Рак желудка на территории Сибири и Дальнего Востока. Факторы риска / Л.Ф. Писарева, Л.А. Коломиец. – Томск.: STT, 2001. – 276с.

  2. [Электронный ресурс]. – Режим доступа: http://progenetix.net/progenetix/locuslinkpage.html, свободный

  3. [Электронный ресурс]. – Режим доступа: www.affimetrix.com, свободный

  4. Assumpção P.P. Numerical aberrations of chromosome 8 detected by conventional cytogenetics and fluorescence in situ hybridization in individuals from northern Brazil with gastric adenocarcinomas // Cancer Genet Cytogenet. – 2006. – Vol. 169. – P.45-49

  5. Bayani J., Squire J.A., Advances in the detection of chromosomal aberrations using spectral karyotyping // Clin. Genet. – 2001. – Vol. 59, P.65-73

  6. Bi J., Lau S.H., et al. Downregulation of ZIP kinase is associated with tumor invasion, metastasis and poor prognosis in gastric cancer // Int J Cancer. – 2008. – Vol. 19. - № 7. – P.1587-1593

  7. Bielas J.H., Loeb L.A. Mutator phenotype in cancer: timing and perspective // Environ. Mol. Mutagen. – 2005. – 45, № 2-3. – P.206-213

  8. Buffart T.E., Carvalho B., et al. DNA copy number profiles of gastric cancer precursor lesions // BMS Genomicg. – 2007. – Vol. 8. – P.345

  9. Choi I-S., Wu T-T. Epigenetic alterations in gastric carcinogenesis // Cell Res. – 2005. – Vol. 15. – P. 247-254.

  10. Chun Y.-H. et al. Characterization of chromosomal aberrations in human gastric carcinoma cell lines using chromosome painting // Cancer Genet. Cytogenet. – 2000. – Vol. 119, P.18 -25

  11. Duesberg P. Rasnick D. Aneuploidy, the somatic mutation that makes cancer a species of its own // Cell. Motility and Cytoskeleton. – 2000. – Vol. 47, P.81-107

  12. Gibbs W. Рак: как распутать клубок // В мире науки. – 2003. - № 10. – С.55-65

  13. Guimaraes A.C., et al. Aneuploidy of chromosome 8 detected by fluorescence in situ hybridization in ACP01 cell line gastric adenocarcinomas // Clin. Exs. Med. – 2006. – Vol. 6, P.129-133

  14. Jones P.A., Baylin S.B. The fundamental role of epigenetic events in cancer // Nat Rev Genet. – 2002. – Vol. 3. – P. 415-428.

  15. Kallioniemi A., Kallioniemi O.-P., et al. Comparative genomic hybridization for molecular cytogenetics analysis of solid tumor // Science. – 1992. – Vol. 258, P.818-821

  16. Kang J.U., Kang J.J., et al. Genetic alterations in primary gastric carcinomas correlated with clinicopathological variables by array comparative hybridization // J. Korean Med. – 2006. – Vol. 21. – P.656-665

  17. Kitayama Y. Nonrandom chromosomal numerical abnormality predicting prognosis of gastric cancer: a retrospective study of 51 cases using pathology archives // Lab Invest. – 2003. – Vol. 83. – P.1311-1320

  18. Kong G., Oga A., et al. DNA sequence copy number aberrations associated with histological subtypes and DNA ploidy in gastric carcinoma // Jpn J Cancer Res. – 2001. – Vol. 92, № 7. – P.740-747

  19. Koo S.H., Kwon K.C., et al. Genetic alterations of gastric cancer: comparative genomic hybridization and fluorescence In situ hybridization studies // Cancer Genet Cytogenet. -2000. – Vol. 117, № 2. - P.97-103

  20. Koshima R., Vieth M., et al. Gastric-type well-differentiated adenocarcinomas and pyloric gland adenoma of the stomach // Gastric Cancer. – 2006. – Vol. 9. – P.177-184

  21. Lauren P. The two histological main types of gastric cancer // IARC Sci. Publ. – 1965. - Vol. 157, P.327-349

  22. Lima E.M., Rissino J.D., et al. Conventional cytogenetic characterization of new cell line ACP01, established from a primary human gastric tumor // Braz. J. Med. Biol. Res. – 2004. – Vol. 37, № 12. – P.1831-1838

  23. Masters J.R.W., Palston B.. Human Cell Culture. - G. Britain: Kluwer Academic Publishers, 1999. – 400

  24. Morohara K., Nakao K., Tajima Y., et al. Analysis by comparative genomic hybridization of gastric cancer with peritoneal dissemination and/or positive peritoneal cytology // Cancer Genet Cytogenet. – 2005. – Vol. 161, № 1. – P.57-62

  25. Noguchi T., Wirtz H.C., Michaelis S., et al. Chromosomal imbalances in gastric cancer. Correlation with histologic subtypes and tumor progression // Am J Clin Pathol. – 2001. – Vol. 115, № 6. – P.828-834

  26. Ohara T. et al. Analysis of differences in structural chromosome aberrations of the gastric mucosa between H. pylori positive and negative gastric cancer patients: Involvement of H. pylori in the onset of gastric cancer and examination of the mechanism in gastric carcinogenesis following H. pylori eradication // Oncology reports. – 2006. – Vol. 16, P.1333-1342

  27. Panani A.D. Cytogenetic and molecular aspects of gastric cancer: clinical implication // Cancer Letters. - 2008. – Vol. 266, P.99-115

  28. Panani A.D., Ferti A., et al. Cytogenetic study of 11 gastric adenocarcinomas // Cancer Genet. Cytogenet. – 1995. – Vol. 81, P.169-172

  29. Peng D.-F., Sugihara H., et al. Alterations of chromosomal copy numbers during progression of diffuse-type gastric carcinomas: metaphase and array-based comparative genomic hybridization analyses of multiple samples from individual tumors // J. Pathol. – 2003. – Vol. 201, P.439-450

  30. Pinkel D., Straume T., Gray J.W. Cytogenetic analysis using quantitative, high-sensitivity, fluorescence hybridization // Proc Natl Acad Sci. – 1986. – Vol.83. – P.2934–2938.

  31. Seruca R., Castedo S. et al. Cytogenetic findings in eleven gastric carcinoma // Cancer Genet. Cytogenet. – 1993. – Vol. 63, P.42-48

  32. Shinya O., et al. Microsatellite instability in gastrointestinal tract cancers: a brief update // Surg. Today. – 2005. – Vol. 35, P.1005-1015

  33. Smith M.G. et al. Cellular and molecular aspects of gastric cancer // World J. Gastroenterol. - 2006. – Vol. 12, № 19. – P.2979-2990

  34. Takada H., Imoto I., et al., et al. Screening of DNA copy-number aberrations in gastric cancer cell lines by array-based comparative genomic hybridization // Cancer Sci. – 2005. – Vol. 96, № 2. – P.100-110

  35. Tamura G. Alterations of tumor suppressor and tumor-related genes in the development and progression of gastric cancer // World J. Gastroenterol. – 2006. – Vol.2, № 2. - P.192-198

  36. Tamura G., et al. Allelotype of adenoma and differentiated adenocarcinoma of the stomach // J. Patology. – 1996. – Vol.180, P.371-377

  37. Vogiatzi P., et al. Deciphering the underlying genetic to gastric carcinogenesis // J. Cell. physiol. – 2007. – Vol. 211, P.287-295

  38. Weiss M.M., Kuipers E.J., Postma C., et al. Genomic alterations in primary gastric adenocarcinomas correlate with clinicopathological characteristics and survival // Cell Oncol. – 2004. – Vol. 26, № 5-6. – P.307-317

  39. Wu C.W., Chen G.D., Faun A.F.Y., et al. Clinical implication of chromosomal abnormalities in gastric adenocarcinomas // Genes Chromosome Cancer. – 2002. – Vol. 35, P.219-231

  40. Yasuhide Y., Nishida K. et al. Recurrent chromosomal rearrangements at bands 8q24 and 11q13 in gastric cancer as detected by multicolor spectral karyotyping // World. J. Gastroenterol. – 2005. – Vol. 11, P.5129- 5135



<< предыдущая страница  
Смотрите также:
Отчет о выполнении 1 этапа Государственного контракта № П1706 от 23 сентября 2009 г
345.83kb.
3 стр.
Отчет в 4 томах по исполнению I этапа Государственного контракта №07. Р20. 11. 0029 от 7 сентября 2011 г. Том 1
5561.57kb.
25 стр.
Отчету о выполнении 5 этапа Государственного контракта №14. В27. 21. 0467 от 06 августа 2012 по нир «Методика испытания многоцелевых обрабатывающих центров для проведения высокоскоростной обработки»
63.56kb.
1 стр.
Отчет о выполнении работ по шестому этапу государственного контракта №02. 740. 11. 0593 от «22» марта 2010 года на выполнение научно-исследовательских работ в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной
1463.34kb.
7 стр.
Отчет по исполнению I этапа Государственного контракта №07. P20. 11. 0060 от 19 октября 2011 г.
499.89kb.
4 стр.
Отчет о научно-исследовательской работе по исполнению Государственного контракта №900-01-41/06-12 от 23 мая 2012 г по теме
4553.39kb.
25 стр.
Отчет о научно-исследовательской работе по исполнению Государственного контракта №900-01-41/06-12 от 23 мая 2012 г по теме
3371.97kb.
23 стр.
Вопрос: Чем надлежит руководствоваться
38kb.
1 стр.
Отчет о выполнении государственного задания
124.92kb.
1 стр.
Отчет о выполнении мероприятий школьного этапа Соревнований классов «Наше здоровье- в наших руках»
20.54kb.
1 стр.
Отчету о выполнении 2 этапа
42.5kb.
1 стр.
Закон Ростовской области от 12 июля 2011 г. N 623-зс "Об утверждении отчета о выполнении Прогнозного плана (программы) приватизации государственного имущества Ростовской области за 2010 год"
80.31kb.
1 стр.